O Gabinete do Reitor é o órgão central, encarregue pela criação de condições indispensáveis para o pleno desempenho das funções do Magnífico Reitor e dos Vice-Reitores, incluindo a gestão dos respectivos planos e agendas de trabalho. Este órgão garante a correcta implementação das actividades da UEM, através das Unidades Orgânicas da UEM, composta pelas Unidades Académicas; Administrativas; de Investigação e; Especiais e assessores de áreas afins, que devem suportar as decisões a serem tomadas pelo Reitor e pelos Vice-Reitores, relativas a qualquer assunto da vida da Universidade, desde que não sejam matérias de discussões dos Órgãos Colegiais da UEM, nomeadamente, os Conselhos de Directores, de Reitoria, Académico e Universitário.